La Faculté Sciences et Ingénierie est administrée par un conseil et trois commissions :
 

  • La commission pédagogique, élabore des propositions dans les domaines du fonctionnement des formations (calendrier universitaire, emplois du temps, structures d'enseignement et MCCA...) et de l'accréditation de l'offre de formation.
     
  • La commission scientifique  a pour visée de développer les relations entre thématiques et à favoriser l’émergence de l’interdisciplinarité. Elle examine l’adossement des formations à la recherche et identifie les potentialités de développement de formations par rapport aux thématiques de recherche. 
     
  • La Commission des Personnels est force de proposition pour la Direction et le conseil de Faculté. Elle joue un rôle de conseil dans la politique d'évolution de carrière des agents BIATSS de la Faculté.